Tresong Detsun, büyük Hintli eğitmen Shantirakshita'yı (Tibetliler onu Khenchen Zhiwatso olarak bilirler) Buda'nın doktrinlerini öğretmesi için kendi topraklarına davet etti. O sıralar Bon dini Tibet'te hala oldukça yaygın olduğundan Khenchen Zhiwatso Tibetlilerin henüz kendi öğretilerini algılamaya hazır olmadığına karar verdi. Ve ulu Tantrik eğitmen Padmasambha'yı Tibet'e yollamak üzere Nepal'e döndü.

Tibet'te Lopon Rinpoche olarak bilinen Padmasambhava kısa fakat çok daha zor olan Tantrik yolunda aydınlandığı için başarılı olmuştu ve Tibetlilerin çok inanır göründüğü kötü ruhlar hakkında oldukça bilgisi vardı. Aynı zamanda bu kötü ruhlar üzerinde oldukça büyük bir güce de sahipti. İlk manastır Samye'de kuruldu. Samya manastırı, kutsal öğretileri tercüme etmek için bir merkez haline getirildi. Lopon Rinpoche, kendi öğretilerini halka anlatmak için Tibet'te geziler yaptı; fakat bunu Tibetlilerin inançlarını değiştirmeye çalışarak değil, onların inançlarını Budizm'e adapte ederek yaptı. İşte bu, Tibet Budizmi'nin farkının oluştuğu noktadır. Yüzyıllar boyunca, Tibet'te birçok farklı Budizm mezhebi doğmuştur. Bu mezheplerin kuralları ve öğretilerinin birbirinden pek farkı yoktur. Hepsi Buda'nın öğretilerini kendi yollarıyla takip eder.

Batı Tibet'te Budizm'in canlandırılmasında rol oynayan kahramanlardan biri olan Yeshe Od'un daveti üzerine gelen Atisha, rahiplere daha disiplinli ve daha sade bir yaşam tarzı öğretti. Takipçilerine ''Kadampa'' adı verildi. Kadampa'nın fikirleri, sonradan Gelukpa mezhebi tarafından benimsendi. Fakat bazı rahipler Atisha'nın takipçisi olmayı istemediler ve Lopon Rinpoche'un Nyingmapa ya da eski inananlar olarak bilinen eski öğretilerini uygulamayı sürdürdüler; bu da Tibet Budizmi'nin en eski mezhebini oluşturdu.

Sakya Manastırı, Khan Konchog Gyalpo adındaki büyük bir bilge tarafından kuruldu. Sadeliği ve eğitimiyle ünlendi. Sakya Lamaları 13. ve 14. yüzyıllarda Moğolların desteğiyle Tibet'i yönetti. En büyük ve en son mezhebi olan Gelukpa ise büyük bir din eğitmeni olan Tsong Khapa (1357-1419) tarafından kuruldu. Gelukpa mükemmel erdem anlamına gelir. Dalai Lama'nın mezhebi de budur. Bir kopyaları da Hindistan'da bulunan en büyük ve en önemli Gelukpa manastırları ise Sera ve Drepung'tur.